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Anche dopo un secolo, l'origine dei raggi cosmici ad alta energia è ancora una questione aperta. A causa della loro carica elettrica, i raggi cosmici vengono deviati dai campi magnetici intergalattici prima di raggiungere la Terra, impedendo un'associazione diretta con le loro sorgenti di emissione. L'astrofisica multi-messaggero offre un approccio promettente, combinando diverse informazioni trasportate da diversi messaggeri provenienti dalle stesse fonti. In questo contesto, la rivelazione di neutrini e fotoni astrofisici di alta energia provenienti dagli stessi oggetti rappresenta un passo importante verso l'identificazione degli acceleratori di raggi cosmici. Infatti, i neutrini sono traccianti diretti delle interazioni adroniche, essendo prodotti dai raggi cosmici che interagiscono con la materia ambientale o con i campi di radiazione durante la loro accelerazione o propagazione. Si prevede che i raggi gamma siano prodotti nelle stesse interazioni, rendendo l'osservazione congiunta di fotoni e neutrini ad alta energia un'indicazione più forte dei processi adronici della sorgente emittente. La prima potenziale sorgente di neutrini è stata identificata nel 2017, con la rilevazione congiunta di un neutrino ad alta energia, con l'attività di flaring del blazar TXS 0506+056. Più recentemente, sono state osservate prove di emissione di neutrini dalla galassia Seyfert NGC 1068 e dal piano galattico. Questi risultati suggeriscono che molteplici ambienti astrofisici contribuiscono al fondo di neutrini. Questa tesi comprende diversi lavori che affrontano due importanti problemi aperti in questo campo: l'indagine dei processi di emissione all'opera nelle sorgenti di emissione e la ricerca di nuove sorgenti di neutrini (e quindi di raggi cosmici). Mi sono concentrato principalmente sullo studio dei blazar come possibili emettitori di neutrini, ma in questa tesi è incluso anche un follow-up imparziale di eventi di neutrini.